La primera medida para determinar la causa de la muerte de Natalia Fraticelli fue la autopsia que se realizó en el Instituto Médico Legal de Rosario. Estuvo a cargo de Luis Petinari y dictaminó que la chica falleció estrangulada a las 4 del sábado 20 de mayo. El informe explicó la muerte por "asfixia por compresión" y sostuvo que en los músculos del cuello había "signos de haber sufrido ese tipo de presión y que sobre la piel se hallaron exquimosis". El último informe, elaborado por peritos forenses de la Corte Suprema de Justicia de la Nación, coincide con los resultados de la autopsia. Otros informes y pericias que formaron parte del expediente enfrentaron las hipótesis de estrangulamiento con otras por intoxicación. Para definir las causas de la muerte de Natalia, el juez Carlos Risso solicitó como última medida la reunión de una junta de profesionales que deberán expedir su opinión sobre los informes.
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